As pesquisas realizadas na Escola se dão em dois âmbitos: na iniciação científica, ligada aos alunos de graduação, e na pós-graduação.
O programa de Iniciação Científica é coordenado pelo Núcleo de Apoio à Pesquisa (NAPq) que é ligado a Diretoria da Escola e à Pró-reitoria de Pesquisa da UFMG. Este programa se dedica a oferecer aos estudantes de graduação a oportunidade de participar de projetos de pesquisa com qualidade acadêmica, mérito científico e orientação adequada. Estudantes bolsistas ou voluntários podem fazer parte destes projetos e complementar seu aprendizado acadêmico em diferentes áreas do conhecimento.
A pós-graduação da Escola é dividida em dois programas: Ciência Animal e Zootecnia. Com níveis de mestrado e doutorado, estes programas permitem a seus estudantes trabalhar em diferentes linhas de pesquisa, que podem ser conferidas nos projetos de cada um.