O Hospital Veterinário, através da Fundação de Estudo e Pesquisa em Medicina Veterinária e Zootecnia, possui convênio com a Secretaria Municipal de Saúde/Prefeitura de Belo Horizonte (número 01.151284.10.34, instrumento jurídico 01.2010.2300.0497.00.00). Este convênio objetiva promover a melhoria no controle de zoonoses no município de Belo Horizonte, garantindo a realização de atendimento clínico, cirúrgico e demais procedimentos de suporte aos animais sob a responsabilidade da Gerência de Controle de Zoonoses/SMSA.

A Escola de Veterinária e o HV possuem convênio com a cavalaria da Polícia Militar do Estado de Minas Gerais Minas Gerais (original name) Minas Gerais o qual visa cooperar nas demandas clínico-cirúrgicas para animais enfermos e necropsias quando necessário. Na área de Clínica Médica de Equinos há destaque da atuação dos alunos de pós-graduação e residência junto ao projeto em parceria com o Serviço de Limpeza Urbana (SLU) da Prefeitura Municipal de Belo Horizonte, através do “Projeto Carroceiro”. Este projeto foi pioneiro no país e inclusive recebeu premiações nacional e internacional devido a sua atuação social e técnico/científica. Além disso, o HV/UFMG participa do projeto PRO-SAÚDE II, no qual propõe a realização de castrações de animais de proprietários carentes da comunidade de Belo Horizonte, visando o auxílio à secretaria municipal de saúde ao controle de zoonoses.